F7#9 contiene un G#=Ab... ma non è una b3... è una #9.
Devi considerare l'accordo nella sua estensione, altrimenti puoi essere fuorviato dal significato dell'accordo stesso.
L'accordo non rivoltato è F A C Eb Ab... questo accordo suona bluesy e tra l'altro suona un po' sospeso perchè comunque contiene un intervallo di quarta Eb Ab.

Prova suonarlo sul piano (o su Finale/Sibelius) rivoltato così e senti che figata (dal basso verso l'alto): C F A Eb Ab... lo riconosci? ;)

Improvvisandoci sopra può non cambiare molto però il voicing del piano cambia e si sente evidentemente se è un accordo maggiore o un accordo dominante.