Vuol dire che per costruire queste scale (maggiori o minori che siano) devi sempre considerare le alterazioni in chiave presenti in una data tonalitÃ* altrimenti la semplice numerazione che hai indicato non ti serve a nulla.

Per fare un esempio sulla scala bebop maggiore di DO:
- sai che rispetto alla scala maggiore naturale ha in aggiunta la 5a aumentata;
- la scala maggiore è Do, Re, Mi, Fa, Sol, La, Si
- aggiungendo la V aumentata diventa: Do, Re, Mi, Fa, Sol ,Sol#, La, Si

E' chiaro che se invece la scala che vuoi formare non è quella di Do ma di Do# devi considerare le alterazioni che hai in questa tonalitÃ* (7) ricordandoti di aggiungere sempre la 5a aumentata, ovvero:
Do#, Re#, Mi#, Fa#, Sol#, Solx, La#, Si#

E' più semplice di quello che credi... ;)