Ci sono poche applicazioni Android che supportano il MIDI IN a bassa latenza, e non funzionano su tutti gli hardware (devi verificare che il tuo Android supporti "USB OTG") e solo con l'ultimo Android 4.2.X.
Inoltre, i software che supportano MIDI in ingresso, come questo:

http://www.youtube.com/watch?v=wx-DiAEHM0w

sono programmati per ricevere segnali da tastiere (velocity) non da fiati, quindi non potresti modulare la dinamica e ci perderesti parecchio. Purtroppo questo è lo stato attuale delle cose, spero si evolva,