Non sono sicuro di capire cosa ti serva esattamente, ma se e' solo il bordone sul quale suonarci sopra - e se sai in anticipo quali dovranno essere le note del bordone - puoi risolvere con uno di questi sistemi:

- con un midi editor (ti scrivi la partitura del bordone e gliela fai suonare);
- oppure registrando il bordone prima e suonandoci sopra poi.